Prilikom projektiranja i realizacije fotonaponskih sustava koristimo različite vrste fotonaponskih panela: monokristaline, polikristaline, tankoslojne od amorfnog silicija i sl.
Za nas ne postoje univerzalno primjenjivi fotonaponski paneli. Izbor fotonaponskih panela ovisi o geolokaciji, prostornom položaju objekta, orijentaciji objekta, konfiguraciji objekta, okolnim zgradama i drugim uvjetima te o konfiguraciji samog sustava.
Osnovni kriterij prilikom izbora fotonaponskih panela je postizanje maksimalne količine proizvedenih kWh električne energije po kW instalirane snage uz što manju cijenu investicije. Isto vrijedi i za ostalu opremu.